한국만화박물관의 수장고는 우리의 소중한 문화유산을 후대에 온전히 전승할 수 있도록 항온, 항습, 보안, 방재, 최신장비 등 문화재 보존을 위한 최선의 시설을 구비하고 있습니다. 만화가의 피와 땀이 스며있는 육필원고와 희귀 만화자료 등 약 30,000여건이 보관되어 있는 전문보존공간

수장고는 이원화 된 공조시스템으로 사계절 일정한 온·습도가 유지되며, 화재에 대비하여 굳건한 방화문 뿐만 아니라 하론가스분사식 소화방식을 채택하여 2차적인 손상을 원천적으로 차단하고 있습니다.